โรงเรียนลำปลายมาศพัฒนาเกิดจากความคิดของ นายมีชัย วีระไวทยะ นายกสมาคมพัฒนาประชากรและชุมชนและนายเจมส์ คลาร์ค ชาวอังกฤษ ที่ต้องการให้มีโรงเรียนที่เป็นแบบอย่างในการจัดกิจกรรมการเรียนการสอนสร้างเยาวชนให้เป็นคนดีของประเทศ และให้เด็กชนบทมีโอกาสได้รับการศึกษาที่มีคุณภาพเท่าเทียมกับเด็กในเมือง โดยมูลนิธิเจมส์คลาร์คแห่งประเทศอังกฤษเป็นผู้สนับสนุนงบประมาณในการก่อสร้างและการดำเนินการของโรงเรียนฯ 

         ทั้งสองท่านได้ลงนามในบันทึกความร่วมมือในวันที่ 8 สิงหาคม 2544 ทำพิธีวางศิลาฤกษ์เมื่อวันที่ 9 กุมภาพันธ์ 2545 และทำพิธีเปิดโรงเรียนฯ อย่างเป็นทางการในวันที่ 18 มิถุนายน 2546

         โรงเรียนลำปลายมาศพัฒนา ได้เปิดทำการเรียนการสอนในภาคเรียนที่ 1 ปีการศึกษา 2546 เมื่อวันที่ 16 พฤษภาคม 2546 จำนวน 3 ชั้นเรียน ได้แก่ ชั้นอนุบาล 1 ชั้นอนุบาล 2 และชั้นประถมศึกษาปีที่ 1 ได้คัดเลือกเด็กจากเด็กทั่วไปโดยวิธีจับฉลาก นักเรียนที่เข้าเรียนไม่ต้องเสียค่าเล่าเรียน ข้อพิจารณาที่สำคัญคือ ผู้ปกครองต้องพร้อมที่จะให้ความร่วมมือกับโรงเรียนฯ ในการพัฒนาผู้เรียนอย่างเต็มศักยภาพ 

         ปัจจุบันมูลนิธิลำปลายมาศพัฒนา เป็นผู้ถือใบอนุญาตโรงเรียนฯ  และเปิดทำการเรียนการสอนครบ 8 ชั้นเรียน คือ ชั้นอนุบาล1–2 และชั้นประถมศึกษาปีที่1-6